按成矿作用分类
按成矿作用、锰质来源及成矿条件等可划分为六类，分别是：沉积型、火山沉积型、沉积变质型、热液型、风化壳型、海底结核-结壳型。
锰矿石在这几种锰矿石中，工业价值最大的为沉积和受变质矿床，在世界十大锰矿床中，属沉积型矿床的有5个，它们是乌克兰的大托马克和尼科波尔、格鲁吉亚的恰图拉、澳大利亚的格鲁特锰矿床及保加利亚的瓦尔纳锰矿床；属于受变质矿床的有4个，南非的卡拉哈里-波斯特马斯堡、巴西的乌鲁库姆及印度的中央邦-马哈拉施特拉邦锰矿床；属火山型的为加蓬的莫安达锰矿矿床。据统计，世界主要产锰国家的168个锰矿床，属沉积型的有83个，占锰矿床总数的44.62%；受变质型的28个，占总数的15.05%；热液型的34个，占总数的18.25%；火山型的22个，占总数的11.86%；风化型的19个，占总数的10.22%。

按矿物的自然类型分类
按矿物的自然类型和所含伴生元素划分

按锰矿的工业用途划分
A.冶金用锰矿
世界上90%以上的锰矿用于冶金工业，并且绝大部分是把它冶炼成锰合金应用在钢铁生产上。冶金用锰矿按其矿石类型，锰与铁含量之比以及含锰高低又分成三类：
①按锰矿类型可分为氧化锰矿和碳酸锰矿。
②按锰矿中锰、铁含量之比可分为锰矿石、铁锰矿石和含锰铁矿石。主要含锰，且Mn/Fe＞1的矿石称为锰矿石；含有相当数量的锰和铁，但以铁为主，Mn/Fe＜1的矿石，称为铁锰矿石；主要含铁(Fe＞35%)，而含Mn5%～10%的矿石，称为含锰铁矿石。
③按锰矿含锰高低分为富锰矿和贫锰矿。贫富矿的划分标准各国依其矿源条件不同也不一样。我国目前把含Mn30%以上的成品矿石称作富矿。
B.化工用锰矿
化学工业上主要用锰矿石制取二氧化锰、硫酸锰、高锰酸钾，其次用于制取碳酸锰、硝酸锰和氯化锰等。化工级二氧化锰矿粉要求MnO2含量大于50％，制硫酸锰时，Fe≤3％、Al2O3≤3％、CaO≤0.5％、MgO≤0.1％；制高锰酸钾时，Fe≤5％、SiO2≤5％、Al2O3≤4％。
天然二氧化锰是制造干电池的原料，要求MnO2含量越高越好。对Ni、Cu、CO、Pb等有害元素一般厂定标准为：Cu<0.01％、Ni<0.03％、Co<0.02％、Pb<0.02％。矿粉的粒度要小于0.12mm。